Кофеин - это природный алкалоид. Безусловно организмом вырабатывается зависимость и толерантность к кофеину. Достаточно обратиться к википедии.
Тут следует уточнить: а к чему вопрос.?
Учитывая актуальные научные исследования: кофеин полезен для органимза, вопрос лишь, в индивидуальных дозировках.
Извлечение кофеина из кофейных зерен зависит от метода приготовления. Сейчас существует множество вариантов приготовления кофе с учетом индивидуальных потребностей в бородсти/вкусе/плотности напитка.
Конечно бывает, в медицине это называют теизмом. Чаще всего она бывает у людей, кто пьет в день более 5 чашек эспрессо. В нем содержится большое количество алкалоида.