Нет, баллы аттестата/диплома практически никогда не рассматриваются при поступлении.
Замечу, что сдавать сразу и ЕГЭ, и внутренние экзамены, скорее всего, бесполезно. Если вы при поступлении предъявите результаты ЕГЭ, то ко внутренним экзаменам вас не допустят. Если же вы сдадите внутренние экзамены, то результаты ЕГЭ уже не примут.
Единственный смысл - попробовать сдать ЕГЭ и, если баллы будут недостаточно высоки, то сдавать внутренние. Но некоторые вузы в случае с выпускниками колледжей принимают только внутренние результаты. Обязательно уточните в правилах приема конкретного вуза.