Alcatel 6045y можно ли прошить в стоковом рекавери?

В стоковом скорее всего нет. Обычно в нем можно только сбросить до заводских настроек.

По поводу прошивки посмотрите здесь: http://4pda.ru/forum/index.php?showtopic=753533

Там и прошивки и инструкции, и все остальное для вашего телефона.