Здравствуйте, самозанятые лица сами отражают в приложении "Мой налог" поступления, с которых они платят налог. Поэтому, если вы как самозанятая получили оплату от юр лица, то эту сумму надо отразить в приложении "Мой налог" (выбрав, что поступления идут от юридического лица), система уже сама посчитает вам сумму налога.