Тут нужно уточнять период. Всё-таки Смута, середина века и конец века это вообще не одно и то же. А серьёзных, больших обобщающих исследований на эту тему я лично не знаю.
Самое общее, что могу вспомнить — «Московское царство» В.Н. Козлякова. Там, кстати, как раз хороший список библиографии XVII века в конце.
Некоторые книги перечислила здесь. В частности, по теме вопроса подойдут Седов и Новохатко, в некоторой степени Эскин.
Про развитие приказной системы можно почитать у Д.В. Лисейцева; есть вот такой справочник.
Статья по экономическому состоянию начала 1620-х.
Статья (PDF, 477 Kb) про цены второй половины века.
2 эксперта согласны