В состав нормальной микрофлоры полости рта входят бактерии, вирусы, грибы и простейшие. Наиболее многочисленными являются бактериальные биоценозы, которые играют основную роль в поддержании постоянства данного биотопа. Является своего рода индикатором здоровья. При нарушении баланса может произойти активный рост патогенных инфекций : дисбактериоз, молочница, воспалительные заболевания слизистой оболочки рта: гингивиты, пародонтиты , кариес и его осложнения, одонтогеные воспалительные процессы.
На формирование нормальной флоры - влияют состояние слизистой особенности строения (складки слизистой, десневые карманы, слущенный эпителий), температура, рН, состав пищи, секреция ротовой жидкости и ее состав, а также общее состояние организма, иммунитет.