судя по данным викепедии, глифосат считается токсичным препаратом, возможным канцерогеном, по поводу аутоиммунных заболеваний информации о нем нет. Но можно предположить, что косвенно данное средство может вызывать интоксикацию, которая в свою очередь может способствовать развитию в том числе и аутоиммунных процессов.