Конечно
Контекстная реклама никак не влияет на поисковую оптимизацию. Однако, если оптимизировать сайт под поисковую выдачу, то можно получить лучший результат от контекста.
В целом это просто 2 разных рекламных канала, над которыми нужно работать отдельно