Здравствуйте.
Да, псевдоним прописывается в издательском договоре. Договор заключается от реального имени, но вносится условие о псевдониме. При желании этого может быть достаточно.
Псевдоним можно зарегистрировать в международном идентификаторе стандартных наименований (ISNI). По желанию к регистрационной записи можно привязывать произведения.
Цели:
- одно из доказательств авторства,
- решение неоднозначности написания сложных имён,
- разграничение часто встречающихся имён и псевдонимов,
- облегчение взаимодействия на международном уровне,
- более точный поиск информации в базах данных и в Интернете,
- облегчение процесса управления правами.
Можно зарегистрировать товарный знак, но это дороже (от 33 тыс.руб против 4200 руб.).
Товарный знак даёт сильную защиту, но он регистрируется в отношении определённых классов товаров или услуг. Думаю, это имеет место в случае с уже широко известными псевдонимами (вроде Захар Прилепин или Кир Булычёв; есть товарные знаки Николай Цискаридзе, Елена Исинбаева, Алла Пугачёва, Юлия Высоцкая).
Регистрация товарного знака больше подходит для тех, кто под личным брендом распространяет товары или услуги.
Для целей издания произведения рекомендую обязательно внести условие о псевдониме в договор с издательством и по желанию зарегистрироваться в ISNI.