Наши далёкие предки чётко различали звуки, обозначавшиеся буквами i, и, ѵ. Поэтому и были разные буквы, которые пришли из латинского и греческого алфавитов при их творческом переосмысливании под нужды славянских языков. Так буква и появилась. А потом от двух решили отказаться, оставив только одну и.