Есть специальные расчетные (клиринговые) центры у всех платежных систем. Они проводят внутренние взаиморасчеты между участниками. Далее деньги перечисляются обычным межбанком на корсчета участников. Кэша (наличных денег) там, конечно, никакого нет. Только циферки в базах данных.