Возможна ли мена квартиры меньшей на большую с доплатой в виде ипотеки?

Камила, здравствуйте!
В вашем случае Росреестр зарегистрирует право собственности на основании двух договоров купли-продажи.
Несмотря на то, что вы рассматриваете покупку квартиру у ваших соседей, я рекомендую обратиться к специалисту,
так как вы собираетесь покупать квартиру с использованием ипотечных средств и МСК, что подразумевает подбор Программы кредитования вторичного жилья с наиболее оптимальными условиями для вашей семьи.
Что касается МСК, то в первоначальный взнос вносить его нет необходимости.
МСК можно будет использовать при досрочном погашении. Но, в этом случае, у вас наступает обязанность по наделению детей долями в приобретаемой квартире.
Более того, если разница в оценке двух квартир составит, допустим, 1,5 млн, ₽ возможно оформление не ипотеки, а потребительского кредита. В этом случае ваша семья может существенно сэкономить на расходах, которые возникают при оформлении ипотеки. А МСК вы сможете оставить на обучение детей.