В половых хромосомах. Например, гены зрительных фоторецепторов (колбочек), отвечающие за восприятие цвета, сцеплены с полом, так как находятся на Х-хромосоме. А поскольку у женщины две Х-хромосомы, а у мужчины - одна, последние сильнее подвержены дальтонизму в случае мутации в этом гене.