Что будет, если в день списания кредита списалась большая сумма, но не хватало 20 рублей на счёте? 20 рублей списались следующим днём.

Если смотреть с точки зрения просроченной задолженности, то вы на 1 день просрочили платеж (по факту — внесли не в полном объеме в день списания), такие просрочки не критичны и не отразятся на кредитной истории, но, все же советуем в будущем вносить денежные средства в полном объеме за сутки до дня списания.