Проблема Вашего вопроса в том, что на него можно ответить кратко: да, бывает. Вопрос в другом: и что?
Ощущение и интерпретация ощущений, это разные вещи. Атеист и верующий могут описать одно и тоже ощущение по разному.
К тому же, это может быть что-то безобидное, а может быть и дереализация (это уже болезненное переживание). В случае дереализации будет уже не важно, верующий это или атеист.