Как уже отвечали многие до меня — наука никак не доказывает и не опровергает существование Бога. Это не задача науки. Бог по определению трансцендентен, то есть принципиально недоступен опытному познанию, соответственно наука не занимается вопросами существования или несуществования Бога. Вследствии этого и существует такая позиция, как теологический нонкогнитивизм.
Однако, многие религиозные концепции могут быть опровергнуты современными научными данными. Так, например теория эволюции, опровергает библейскую концепцию создания Богом человека на 6 день. Химия опровергает возможность превращения воды в вино по одному лишь желанию.
Наука не опровергает существование Бога, но опровергает религиозные концепции связанные с представлениеми о Боге и его возможностями.