Почему, называя мальчика в честь его отца, говорят «младший», а девочку, названную в честь её матери, называют просто по имени?

Думаю, правильный ответ кроется в дискриминационном законе, который раньше заключался в том, что старшему доставалось большинство наследства или даже всё, а дочери вообще ничего не светило. Отголоски этого закона дошли и до наших дней.