Добрый день!
Удержать алименты и перечислить их взыскателю работодателю нужно не позднее трех рабочих дней после выплаты дохода (ст. 136 ТК, ст. 109 СК, ч. 3 ст. 98, ч. 2 ст. 15 закона от 02.10.2007 № 229-ФЗ).
Поэтому, вы должны были получить выплаты с выплаченных ему отпускных, а после отпуска - с первой заработной платы.