Здравствуйте! Отключить появление таких уведомлений вы можете сразу в самом всплывающем окошке, нажав на три черточке в правом верхнем углу уведомления и перейдя в настройки.
Или можно сделать это по такому пути: значок меню (≡) в правом верхнем углу окна браузера -> Настройки -> раздел «Сайты» в левом столбце на открывшейся странице.
В блоке «Уведомления» нажмите «От сервисов Яндекса».
Вы также можете настроить уведомления здесь https://yandex.ru/tune/desktopnotifications/browser?from=push.