Владимир, здравствуйте! Для ИП на ОСНО отказ от общей системы налогообложения возможен с первого числа любого месяца в году. Получить освобождение от НДС за 3 предшествующих года невозможно. Например, если вы решили получить льготу с 1 сентября, документы нужно подать до 20 сентября. Право не уплачивать налог на добавленную стоимость действует в течение 12 месяцев, начиная с того месяца, в котором оно возникло. Отказаться от него в течение года не получится.
За несвоевременную подачу документов не предусмотрено санкций, но по этой причине налогоплательщик может утратить право на освобождение от уплаты НДС.