Имущество ИП и физ.лица юридически неделимо и различается только для целей налогообложения как используемое и не используемое в предпринимательской деятельности.
Поэтому не вижу проблем с передачей денежных средств в долг ООО: заключаете договор займа с ООО и переводите деньги со своего счета физ.лица на счет ООО.