Добрый день.
Судебную экспертизу можно оспорить только в рамках судебного разбирательства. Для этого стоит заявить ходатайство о вызове эксперта для дачи пояснений по факту проведенного исследования, а также ходатайство о назначении повторной или дополнительной судебной экспертизы. Для оценки обоснованности экспертного заключения лучше обратиться к специалисту, чтобы он выразил свое мнение по этому вопросу (например, в форме рецензии или подобного по смыслу документа). Мнение специалиста в письменной форме стоит приложить к ходатайствам.
Вы можете заказать рецензию на проведенную экспертизу у эксперта с аналогичными компетенциями, и представить ее в суд. Возможно, судья примет во внимание доводы, приведенные в рецензии