Да, естественно бан в Dota 2 никак не повлияет на то что вы будете делать в CS:GO так как это две совершенно разные игры и я не думаю что Valve дав вам бан в доте даст и запрет на обмены в CS:GO. Я получал разок Vac но при этом на другие игры это никак не влияла.
Запрет на действия будет распространяться только в той игре - где его получили. Поэтому, вы можете без проблем совершать все обмены в CS:GO и других играх от Valve.