Если за основу взять ВШЭ, обе специальности там есть и аккредитацию они прошли.
"Информатика и вычислительная техника" - это про технику, про программирование не для человека, а для работы техники, систем, сетей, вычислительных комплексов. На курсе по мимо программирования изучается физика, схемотехника, электроника, микроконтроллеры. В качестве партнеров программы выступает, например, Алмаз-Антей (зенитно-ракетное и радиолокационное оборудование).
"Программная инженерия" в сторону программирования для человека, про управление данными.
На мой взгляд первая специальность сурово сложнее, но для меня в принципе работа с техникой или для техники - это ужас как сложно :), а с данными работаю уже лет эдак 15 и большую часть из специальности "Программная инженерия" знаю, хоть ее и не заканчивала.